Ngày 17/10/2000, Bộ Chính trị Ban Chấp hành Trung ương Đảng Cộng sản Việt Nam đó ban hành Chỉ thị số 58 - CT/TW về đẩy mạnh ứng dụng và phát triển CNTT phục vụ sự nghiệp công nghiệp hoá, hiện đại hoá. Ngày 03/12/2002, Thủ tướng Chính phủ đó ra Quyết định số 176/2002/QĐ-TTg thành lập Ban Chỉ đạo Quốc gia về Công nghệ Thông tin nhằm chỉ đạo thực hiện Chỉ thị 58 trờn phạm vi toàn quốc. Chính phủ đã có Đề án 112 của về Tin học hóa Quản lý Hành chính Nhà nước từ năm 2001. Ngày 6 tháng 10 năm 2005, Thủ tướng Chính phủ đã có Quyết định số 246/2005/TTg phê duyệt “Chiến lược phát triển CNTT và truyền thông Việt Nam đến năm 2010 và định hướng đến năm 2020”
Nhận thức được tầm quan trọng của CNTT, Bộ Y tế đã thành lập Trung tâm tin học là đơn vị trực thuộc Bộ, Phòng CNTT là đơn vị trực thuộc Văn phòng. Tháng 10 năm 2004 đã đưa vào hoạt động trang tin điện tử (Website) của Bộ Y tế; thực hiện nối mạng LAN và Internet băng thông rộng ADSL tại cơ quan Bộ; Thực hiện thí điểm cầu truyền hình, Telemedicine cho một số dịch vụ kỹ thuật cao như các can thiệp về tim mạch, mổ nội soi… tại một số bệnh viện lớn của ngành. Từ cuối năm 2004, Văn phòng Bộ đã triển khai chương trình nghiên cứu khoa học công nghệ cấp Bộ về “đánh giá thực trạng và đề xuất định hưng chiến lược phát triển CNTT ngành y tế cho 10 năm tới”. Cuối năm 2005, được sự tài trợ của SIDA Thuỵ Điển, Văn phòng Bộ Y tế đã khẩn trương cùng với các chuyên gia trong và ngoài nước soạn thảo “Chiến lược phát triển CNTT ngành y tế giai đoạn 2006-2015”. Đến nay dự thảo chiến lược đã hoàn thành.
Ngày 18 tháng 3 năm 2006 tại Hải Phòng, Bộ Y tế đã tổ chức Hội thảo lấy ý kiến đóng góp của đại diện các Bộ, ngành có liên quan, SYT các tỉnh, thành phố, các đơn vị trực thuộc Bộ, các cơ sở y tế tư nhân, các doanh nghiệp dược và thiết bị y tế… để bổ sung hoàn chỉnh trình lãnh đạo Bộ phê duyệt cho ban hành vào quí 3/2006. Hội thảo do TS. Dương Quốc Trọng, Chánh Văn phòng Bộ Y tế – chủ trì
Tham dự Hội thảo có: Đ/c Hoàng Quốc Lập Chánh Văn phòng Ban Chỉ đạo Quốc gia về CNTT, đại diện Cục ứng dụng CNTT Bộ Bưu chính – Viễn thông; Ông Đặng Hoàng Giang, chuyên gia quốc tế của SIDA; Sở Y tế một số tỉnh, thành phố đại diện cho cả 3 miền; các đơn vị trực thuộc Bộ (bao gồm các bệnh viện công lập và tư nhân, Viện nghiên cứu, Trường Đại học, một số doanh nghiệp dược và thiết bị y tế… là những đơn vị đã bước đầu có ứng dụng và phát triển CNTT trong quản lý nhà nước và cung ứng các dịch vụ y tế. Tham dự còn có đại diện các vụ, cục, Văn phòng thuộc Bộ Y tế; đại diện một số công ty chuyên ngành CNTT như Văn phòng đại diện Nortel Việt Nam và Microsoft Việt Nam cùng tham dự Hội thảo.
Khai mạc Hội thảo, Ts Dương Quốc Trọng – Chánh Văn phòng Bộ Y tế đã nhấn mạnh đây là một cơ hội lớn để chúng ta đi tắt đón đầu. Cụm từ “đi tắt đón đầu” đã xuất hiện ở các văn bản của Đảng và nhà nước, không phải ngẫu nhiên có được cụm từ này. Có thể nói CNTT là một trong những công cụ để chúng ta vượt lên, “đi tắt đón đầu”; trước đây chúng ta chủ yếu dựa vào kinh nghiệm, máy móc, bây giờ chúng ta phải dựa vào trí tuệ, hàm lượng chất xám và người Việt Nam có trí tuệ và chất xám không thua kém bất cứ một dân tộc nào trên thế giới để phát triển CNTT, coi đó là một trong những công cụ quan trọng đ phát triển kinh tế tri thức. Đây là cơ hội, đồng thời cũng là thách thức để qua việc đánh giá thực trạng CNTT của ngành y tế, chúng ta biết được đang ở đâu, nhưng không tự ti và cần phải có bước đi thích hợp để theo kịp và tìm cách vượt lên các nước trong khu vực về lĩnh vực quan trọng này.
Tuy công nghệ thông tin y tế nước ta còn có khoảng cách so với các nước trong khu vực và trên thế giới nhưng chúng ta có nền tảng của hệ thống y tếmà các nước phát triển cũng phải coi đó là mẫu hình để học tập. Hệ thống y tế của chúng ta quản lý sức khoẻ người dân đến từng người từ khi lọt lòng cho đến lúc chết. Nếu chúng ta phát triển tốt CNTT thì y tế nước ta không những có thể đuổi kịp mà còn có thể vượt qua họ. Chúng ta đang có cơ sở của một hệ thống y tế toàn diện và chúng ta đang tiếp nối hệ thống ấy. Đồng chí đề nghị Hội thảo bên cạnh việc đánh giá thực trạng CNTT của ngành y tế, các thành tựu đã đạt được và các tồn tại, thách thức trong việc ứng dụng CNTT trong quản lý ngành y tế như quản lý nhân sự, quản lý tài chính, quản lý các văn bản quy phạm pháp luật..., Hội thảo cần tập trung nhiều thời gian hơn vào dự thảo chiến lược phát triển CNTT ngành Y tế giai đoạn 2006-2015 bao gồm các quan điểm, mục tiêu, giải pháp để xác định rõ đúng mình đang ở đâu và sẽ đi đến đâu để từ đó có lộ trình, bước đi thích hợp.
Hội thảo làm việc trong hai ngày: Chiều 18-3 nghe báo cáo về hiện trạng và chiến lược phát triển CNTT ngành Y tế giai đoạn 2006-2015; nghe giới thiệu về mô hình phát triển CNTT tại một số nước. Các đại biểu đã tham gia thảo luận sôi nổi về phát triển CNTT trên các lĩnh vực: quản lý hành chính nhà nước, cung ứng các dịch vụ y tế (điều trị, phòng bệnh, phòng chống dịch); đào tạo cán bộ và sản xuất kinh doanh thuốc và thiết bị y tế. Sáng 19-3, nghe đại diện các tổ báo cáo kết quả thảo luận và tiếp tục tham luận tại Hội trường; nghe đại diện một số công ty giới thiệu các giải pháp về chuyên môn kỹ thuật CNTT áp dụng trong ngành Y tế như chữa bệnh từ xa (telemedicine), đào tạo từ xa (e-learning) để từđó có sự hợp tác tốt hơn trong việc phát triển CNTT y tế.